在軌道交通和諧波治理中，三相變單相變壓器的作用主要是通過將三相電壓轉換為單相電壓，以此來實現對電能質量的改善。三相變單相變壓器的原理基于電磁感應和法拉第電磁感應定律，通過調整繞組的匝數比例，可以實現從一個電壓級別向另一個電壓級別的變換。這種變壓器能夠將三相電壓轉換為單相電壓，并且還具有其他一些應用。

在軌道交通供電系統中，諧波問題是一個重要的挑戰，因為諧波量的增大會影響地鐵設備系統運行安全。有源濾波器被證明可以有效地治理諧波，將諧波對供電系統的損害降低，從而保障軌道交通的供電可靠性。然而，三相變單相變壓器在處理諧波方面的直接效果并未在我搜索到的資料中明確提及。不過，考慮到其基本功能，即轉換電壓，可以推測其在特定情況下可能通過改變電壓水平或調整電流分布間接影響諧波的控制。

盡管如此，需要注意的是，三相功率平衡是使用三相變單相變壓器的一個關鍵因素。如果三相功率不平衡，可能會導致效率降低。因此，在軌道交通和諧波治理中，雖然三相變單相變壓器可以作為一種技術手段，但其效果可能受到多種因素的影響，包括但不限于三相功率的平衡狀態、變壓器的具體配置以及整個供電系統的設計和運行方式。

三相變單相變壓器在軌道交通和諧波治理中的作用和效果可能較為間接，其主要通過轉換電壓來影響電能質量，而非直接消除諧波。